Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFIP11Q9UBB9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms