Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC180Q9P1Z9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC180Q9P1Z9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms