Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms