Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms