Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms