Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms