Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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