Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC4Q9NTJ3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms