Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A2Q9NTI2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A2Q9NTI2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms