Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms