Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms