Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms