Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms