Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms