Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms