Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC2Q9BYS8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms