Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms