Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms