Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms