Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REPIN1Q9BWE0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms