Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM2Q9BVW6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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