Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC32Q9BV29 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms