Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDHD3Q9BSH5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms