Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms