Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms