Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms