Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms