Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRERF1Q96PN7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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