Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms