Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms