Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NBPF4Q96M43 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms