Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPNS2Q96L46 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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