Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms