Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms