Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUNDC1Q96C34 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms