Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB7BQ96AH8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB7BQ96AH8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB7BQ96AH8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB7BQ96AH8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB7BQ96AH8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms