Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms