Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms