Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM54Q969K7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms