Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKD1Q969G9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms