Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TAF4BQ92750 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF4BQ92750 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms