Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms