Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRF4Q8WWF5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRF4Q8WWF5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRF4Q8WWF5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRF4Q8WWF5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRF4Q8WWF5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRF4Q8WWF5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRF4Q8WWF5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRF4Q8WWF5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms