Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms