Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms