Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms