Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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CLDN19Q8N6F1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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CLDN19Q8N6F1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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