Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC47Q8N1G4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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