Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC2Q8N158 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC2Q8N158 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms