Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms